Taksonominin kökeni, "koordinasyon" anlamına gelen Yunanca bir kelimedir. Bu, hayvan ve bitki gruplarının sistematik ve hiyerarşik organizasyonu için biyolojide uygulanan sınıflandırma bilimidir .

Spesifik olarak, taksonominin ikiye bölündüğünü belirleyebiliriz: belirli türlerin sınırlandırılması ve tanımlanmasından sorumlu olan mikrotaksonomi; ve önceki şube tarafından verilen kriterlere göre sınıflandırılan makrotaksonomi.

Taksonominin, sistematik olarak bilinenlerle çok ilgili olduğunu tespit etmek de önemlidir. Bu, farklı türler arasında meydana gelen yakınlıklar olarak da adlandırılan akrabalık ilişkileri çalışmasının yürütülmesinden sorumlu olan bilim olarak tanımlanabilir.

Bütün bunlar, taksonomi ile diğer bilimler veya evrim, paleontoloji, genetik, moleküler biyoloji, filogen veya embriyoloji gibi konular arasındaki yakın bağlantıya bakmadan.

Biyolojik taksonomi, organizmalar arasındaki akrabalık ilişkilerinin analizine adanmış sistematik biyolojinin bir parçasıdır. Söz konusu organizmanın filogenetik ağacı çözüldüğünde ve evrimsel dalları bilindiğinde, taksonomi akrabalık ilişkilerini incelemekten sorumludur.

Tüm bunlara ek olarak, taksonomi ile çalışırken, onu geliştirirken ve uygulamaya koyarken, içinde temel olan farklı kavramları açıklığa kavuşturmanın hayati önem taşıdığı vurgulanmalıdır. Bu, aşağıdaki gibi olacaktır:

Örneğin, bitkinin özelliklerine atıfta bulunan karakter.

Karakterin durumu, yani karakterin elde edebileceği değerler.

Tanı karakterleri, taksonları ayırt etmek için açık bir şekilde kullanılan karakterlerdir.

Türetilmiş karakterler Dinamik tipte oldukları ve yeni soyların ortaya çıkışı hakkında bilgi sağlayabildikleri için tanımlanmaktadırlar. Bütün bunlar, modifiye edildikleri için atalarına farklı bir karaktere sahip olan devletler tarafından yapılabilir.

Taksonomiye ilişkin olarak farklı pozisyonlar vardır, ancak genel olarak taksonun filogeni tanımlandığında fonksiyonunun başladığına dikkat edilir. Taksonominin filogenetik ağacı bir sınıflandırma sistemi içerisinde organize etmesinin nedeni budur.

En yaygın görünüm taksonları, halihazırda bir taksonomik kategoriye atanmış olan klavuzlar (ortak atalarla ilişkili türlerle filogenetik ağacın dalları) olarak anlamaktadır.

Taksonomi süreci, isimlerin verilmesi (isimlendirme prensiplerine göre), iki boyutlu tanımlama anahtarlarının hazırlanması ve sınıflandırma sistemlerinin oluşturulması ile devam eder.

Taksonlar, canlıları içerme hiyerarşisine göre sınıflandırmaya izin verir (her grup daha büyük birine bağlıyken diğer küçükleri de içerir). En kapsamlıdan en küçüğüne kadar temel kategoriler, alan, krallık, sınır veya bölünme, sınıf, düzen, aile, cins ve türlerdir .

DNA bilgisi ve biyoçeşitlilik problemlerindeki ilerlemelerin taksonomide büyük zorluklar yarattığı belirtilmelidir.